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Bücher u.a.
Hoppe T.: Untersuchungen zur Entwicklungsphysiologie und molekularen Phylogenetik ausgewählter Vertreter der Myxomyceten und zur Photosynthese fähiger Eugleniden (Organismenreich Protoctista). Kassel University Press, 2009, Kassel.
Hoppe T. & Kutschera U.: Plasmodiale Schleimpilze: Die kommunikativen zellulären Räuber unserer Wälder. – IN: U. Kutschera (Hrsg.): Darwinia Nova – Verborgene Kunstformen der Natur. LIT-Verlag, 2011, Berlin, Münster, Wien, Zürich, London.
Kutschera U. & Hoppe T.: Anton de Bary, das Reich der Myxomyceten und Biodiversitäts-Forschung. – IN: U. Kutschera (Hrsg.): Darwinia Nova – Verborgene Kunstformen der Natur. LIT-Verlag, 2011, Berlin, Münster, Wien, Zürich, London.
Walker LM., Hoppe T. & Silliker ME.: Molecular techniques and current research approaches. – IN: Stephenson SL. & Rojas C. (Hrsg.): Myxomycetes – Biology, Systematics, Biogeography, and Ecology. Elsevier, 2017, London, San Diego, Cambridge Oxford.
Walker LM., Silliker ME. & Hoppe T.: Molecular techniques and current research approaches. – IN: Stephenson SL. & Rojas C. (Hrsg.): Myxomycetes – Biology, Systematics, Biogeography, and Ecology. Second Edition, Elsevier, 2021, London, San Diego, Cambridge Oxford.
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Zeitschriftenartikel u.a.
Müller H., Hoppe T. & Ferchen T. (2008): Didymium nigripes - Notiz über einen aquatischen Schleimpilz. Deutsche Aquaristische Zeitschrift 6: 80-81..
Hoppe T. & Kutschera U. (2010): In the shadow of Darwin: Anton de Bary’s origin of myxomycetology and molecular phylogeny of the plasmodial slime molds. Theory Biosci. 129: 15-23.
Hoppe T., Müller H. & Kutschera U. (2010): A new species of Physarum (Myxomycetes) from boreal pine forest in Thuringia (Germany). Mycotaxon 114: 7-14.
Hoppe T., Peters K. & Schmidt F.J. (2011): Methylobacterium bullatum sp. nov., a new bacteria species isolated from Funaria hygrometrica. Syst. App. Microbiol. 34: 482-486.
Wegner C., Fischer O. & Hoppe T. (2013): Mikrobiologie in der Schule – Schleimpilze erobern den Klassenraum. In einer praktischen Unterrichtseinheit untersuchen wir die Leistungen des prominentesten Vertreters der Schleimpilze. Praxis der Naturwissenschaften 62: 41-45.
Hoppe T. (2013): Molecular diversity of myxomycetes near Siegen (Germany). Mycoscience 54:309-313.
Hoppe T. & Kutschera U. (2014): Comparative chromosome numbers of myxomycetes: a systematic cytogenetic study of slime molds. Mycol. Research 13: 189-192.
Hoppe T. & Schwippert W.W. (2014): Hydrophobicity of myxomycete spores: An undescribed aspect of spore ornamentation. Mycosphere 5:554-559.
Hoppe T. (2014): Schleimpilze am Wegesrand – Die Myxomycetenfauna des Siegerlandes. Beiträge zur Tier- und Pflanzenwelt des Kreises Siegen-Wittgenstein 10:5-9.
Hoppe T., Ammon L. & Moll J.K. (2014): Diversity and sporocarp development of lignicolous myxomycetes in young timber forests of western Germany. Austrian Journal of Mycology 23:131-141.
Hoppe T. & Schnittler M. (2015): Characterization of myxomycetes in two different soils by TRFLP-analysis of 18S rRNA. Mycoshere 6: 216-227.
Wegner C., Welz T. & Hoppe T. (2015): Leuchtbakterien auf Heringshaut – Eine Unterrichtsreihe zum Thema Biolumineszenz. Praxis der Naturwissenschaften. 64: 40-42.
Hoppe T. & Kutschera U. (2015): Species-specific cell mobility of bacteria-feeding myxamoebae in plasmodial slime molds. Plant Signal. & Behav. 10: e1074268.
Feng Y., Klahr A., Janik P., Ronikier A., Hoppe T., Novozhilov YK. & Schnittler M. (2016): What an intron may tell: several sexual biospecies coexist in Meriderma spp. (Myxomycetes). Protist 167: 234-253.
Dahl MB., Brejnrod AK., Unterseher M., Hoppe T., Feng Y., Novozhilov Y., Sørensen SJ., Schnittler M. (2017): Genetic barcoding of dark‐spored myxomycetes (Amoebozoa)–identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studiesExterner Link. Molecular Ecology Resources 10: DOI 10.1111/1755-0998.12725.
Hoppe T. (2017) What is the best?: A four marker phylogenetic study of the dark-spored myxomycete Fuligo septica. Mycosphere 8:1975–1983.
Kutschera U. & Hoppe T. (2019): Plasmodial slime molds and the evolution of microbial husbandry. Theory Biosci. 138:127–132. doi: 10.1007/s12064-019-00285-3.